WGCNA 模块-性状热图改用 BH 校正 p 值，并支持 job 置顶与优先级排序

gfa_core/schemas/stages/rnaseq_wgcna_contract_v1.md

@@ -46,6 +46,7 @@
 - `{prefix}.rnaseq_wgcna.module_eigengenes.tsv`
 - `{prefix}.rnaseq_wgcna.module_trait_correlation.tsv`
 - `{prefix}.rnaseq_wgcna.module_trait_pvalue.tsv`
+- `{prefix}.rnaseq_wgcna.module_trait_padj.tsv`
 - `{prefix}.rnaseq_wgcna.wgcna_summary.tsv`
 
 ### final/ 图形产物
@@ -103,8 +104,16 @@ moduleColors <- labels2colors(dynamicMods)
 merge <- mergeCloseModules(datExpr, moduleColors, cutHeight = mergeCutHeight)
 MEs <- merge$newMEs
 moduleTraitCor <- cor(MEs, traits, use = "p")
+moduleTraitPvalue <- corPvalueStudent(moduleTraitCor, nSamples = nrow(datExpr))
+moduleTraitPadj <- matrix(
+  p.adjust(as.vector(moduleTraitPvalue), method = "BH"),
+  nrow = nrow(moduleTraitPvalue), ncol = ncol(moduleTraitPvalue),
+  dimnames = dimnames(moduleTraitPvalue)
+)
 ```
 
+模块-性状热图单元格显示相关系数与 `moduleTraitPadj`。校正范围为当前热图中的全部模块×性状检验，方法为 Benjamini-Hochberg；原始 P 值继续写入 `module_trait_pvalue.tsv` 供追溯和兼容旧下游。
+
 ## 7. 解释限制
 
 WGCNA 对样本数量敏感。少样本数据可以完成计算，但模块稳定性和模块-性状相关性需要谨慎解释，建议后续进行模块稳定性或重采样验证。