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potaser f745ee9d7e Initial commit: PlantAI-dev

2026-08-03 18:42:47 +08:00

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bbav20311 项目修订最终总结

修订时间: 2026-04-12 02:39 - 03:50 项目: bbav20311 微信 MCP 服务集成状态: ✅ 修订完成

修订目标

实现完整的微信端基因家族分析工作流，支持多阶段分析（鉴定→进化树→Motif→...）。

完成的工作

1. 微信服务完善 ✅

文件: /home/xia-lab/wutx/00test/bbav20311/wechat_service.py

功能:

MCP工具调用封装
消息收发处理
命令解析
任务完成通知
会话记忆系统
多阶段分析支持

支持命令:

分析 Ft.SPL          - 创建分析任务
状态                  - 系统状态
历史/任务             - 任务历史
最新/最近             - 最新任务
分析完了吗            - 查询完成状态
流程/进度             - 分析流程图
继续分析              - 可执行阶段
帮助                  - 命令列表

2. 数据优化 ✅

改进: 符号链接代替文件复制

os.symlink(source_input, target_input)

效果:

避免10GB+ FASTQ文件复制
数据准备瞬间完成
节省磁盘空间

3. 任务通知系统 ✅

功能:

异步任务状态轮询（每5秒）
任务完成后自动微信通知
包含：Job ID、基因家族、成员数量、耗时

4. 会话记忆 ✅

数据结构:

user_sessions = {}      # 任务历史
user_active_jobs = {}   # 活跃job

功能:

记录最近10个任务
任务状态实时更新
支持历史查询

5. 多阶段分析 ✅

核心功能:

同基因家族复用同一个 job
自动记录已完成阶段
阶段依赖检查

阶段依赖:

identify → phylogeny → motif/domain/structure/promoter
         → synteny

测试验证:

阶段	耗时	结果
identify	37s	✅ 24个成员
phylogeny	172s	✅ 进化树
motif	47s	✅ Motif图

6. 前端修复 ✅

文件: /home/xia-lab/wutx/00test/bbav20311/apps/web/vue3/index.html

修复:

jobInfo 未定义问题
Agent状态组件数据传递

测试结果

测试Job

Job ID: job_1775900738746 基因家族: Ft.SPL 测试时间: 2026-04-12

生成文件

final/
├── Ft.SPL.final_members.id          (24个基因)
├── Ft.SPL.final_members.pep.fa      (蛋白序列)
├── Ft.SPL.tree.nwk                  (进化树)
├── Ft.SPL.motif.png                 (Motif图)
├── Ft.SPL.motif.tree_motif.png      (组合图)
├── Ft.SPL.identify_report.md
├── Ft.SPL.phylogeny_report.md
├── Ft.SPL.motif_report.md
└── *.manifest.json

验证结果

✅ 同Job多阶段执行
✅ 阶段依赖检查
✅ 结果文件累积
✅ 微信服务集成
✅ 任务完成通知

文件位置

/home/xia-lab/wutx/00test/bbav20311/
├── wechat_service.py                    # 微信服务
├── apps/web/vue3/index.html             # 前端
├── docs/revisions/
│   ├── 2026-04-11-wechat-mcp-v2.md      # 初始记录
│   ├── 2026-04-12-0330-progress.md      # 3:30进度
│   ├── 2026-04-12-0350-progress.md      # 3:50进度
│   └── 2026-04-12-final-summary.md      # 本文件
├── .revision_memory.json                # 修订记忆
├── input/job_1775821345494/             # 测试数据源
└── workspace/job_1775900738746/         # 示例工作目录
    └── final/                           # 测试结果

遗留事项

优先级 P1

测试更多阶段（domain, structure, promoter, synteny）
微信端结果展示优化
任务取消功能

优先级 P2

会话记忆持久化
用户权限管理
监控和日志

下一步计划

扩展测试: 完成剩余分析阶段测试
生产化: 添加错误处理和重试机制
优化: 微信端结果展示和交互

修订记录时间

3:30 进度记录: ✅ 完成
3:50 进度记录: ✅ 完成
最终总结: ✅ 完成

修订状态: 核心功能已完成并验证

记录时间: 2026-04-12 03:50

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