PlantAI-dev/memory/2026-03-30-revision-progress.md

2026-03-30 修订进度记录

时间: 01:47 备份状态: ✅ 已完成 (bbav20311_backup_20260330, gene-family-mas-v2_backup_20260330)

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修订计划

Phase 1: 高优先级修订（并行执行中）

脚本	子Agent	状态	开始时间	完成时间
run_expression.py	agent:main:subagent:e775fc93-ecf4-4827-ac6f-4dc8ac452094	🔄 修订中	01:47	-
run_interspecies_synteny.py	agent:main:subagent:b3090aee-a277-430b-8cdc-67d34a7a3550	✅ 已完成	01:47	01:50
run_promoter.py	agent:main:subagent:48814e02-acbc-485d-82cf-5c42939369ab	✅ 已完成	01:47	01:51

已完成修订:

• ✅ run_interspecies_synteny.py - manifest格式已符合schema v1标准
• ✅ run_promoter.py - 添加prepare_directories()，完善manifest（含figures字段）

Phase 2: 中优先级修订（待执行）

脚本	评分	主要问题
run_genome_prepare.py	8.5/10	manifest格式不完全规范
run_synteny.py	9/10	prepare_directories()未独立
run_karyotype.py	9/10	prepare_directories()未独立

Phase 3: 低优先级修订（可选）

脚本	评分	主要问题
run_motif.py	9.5/10	几乎完整，仅需微调
run_domain.py	9.5/10	几乎完整，仅需微调
run_identify.py	9/10	良好，仅需微调

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时间节点

• 01:41 - 完成分析脚本规范性评估
• 01:47 - 启动Phase 1修订（3个并行任务）
• 03:30 - 第一次备份
• 03:50 - 第二次备份
• 04:10 - 检查修订进度

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修订位置确认

所有修订都在备份目录进行：

• 源目录: /home/xia-lab/wutx/00test/bbav20311/
• 备份目录: /home/xia-lab/wutx/00test/bbav20311_backup_20260330/
• 修订在备份目录进行，测试通过后复制回源目录

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记录位置: /home/xia-lab/wutx/00test/bbav20311/memory/2026-03-30-revision-progress.md 状态: ✅ 已记录