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Structure Skill - 基因结构分析技能

概述

分析基因家族成员的基因结构（外显子-内含子）。

功能

• 从GFF3提取基因结构信息
• 生成外显子-内含子结构图
• 计算基因长度、外显子数量等统计

输入

• gff3: 基因组GFF3注释文件
• gene_list: 基因ID列表

输出

• gene_structure.png: 基因结构图
• gene_structure.gff: 提取的基因GFF
• 可复现性文件包

使用方法

# 基本用法
python run.py --gff genome.gff3 --genes gene_list.txt --output ./structure

# Demo模式
python run.py --demo --output ./structure

依赖

• biopython
• pandas
• matplotlib
• seaborn

技能版本

1.0.0