From 0995dcbe77a2e31e2cb72a5357f9d801b3293c5b Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: admin Date: Sun, 6 Sep 2026 09:12:48 +0800 Subject: [PATCH] =?UTF-8?q?docs(bioflow):=20playbook=20=E8=A1=A5=20=C2=A71?= =?UTF-8?q?0=20BIOFLOW=5FDATA=20=E5=AE=B9=E5=99=A8=E5=86=85=E8=BD=AF?= =?UTF-8?q?=E9=93=BE=E6=96=AD=E9=93=BE=E9=99=B7=E9=98=B1(P7=20=E7=BB=88?= =?UTF-8?q?=E9=AA=8C=E5=AE=9E=E6=B5=8B)?= MIME-Version: 1.0 Content-Type: text/plain; charset=UTF-8 Content-Transfer-Encoding: 8bit Co-Authored-By: Claude Fable 5 --- docs/bioflow_image_build_playbook.md | 10 ++++++++++ 1 file changed, 10 insertions(+) diff --git a/docs/bioflow_image_build_playbook.md b/docs/bioflow_image_build_playbook.md index 3be7b1b..fae43c4 100644 --- a/docs/bioflow_image_build_playbook.md +++ b/docs/bioflow_image_build_playbook.md @@ -136,6 +136,16 @@ USER root > 台账中「(待测)」体积与「(待确认)」用途由执行 agent 在构建过程中实测/核实后回填。 +## 10. BIOFLOW_DATA 数据根部署陷阱（2026-09-06 P7 终验实测） + +- **容器内断链**：数据根 zh/bioflow-data 下的 hmm/ 与 rag_db/pfam_mapping.json 若是 + 指向宿主其他位置的软链，容器内（挂载进 docker）是断链——identify 报 + 「本地Pfam映射不存在」+「未能从本地映射或RAG服务获取基因家族Pfam」。 +- **处置**：挂载进容器的数据必须真实文件（cp -aL 解链复制），不能软链。 + 已修复：hmm（3.9G 真实文件）+ rag_db/pfam_mapping.json（377B 真实文件）。 +- **验证**：容器内 ls /bioflow-data/hmm 可见 Pfam-A.hmm* 五文件、 + /bioflow-data/rag_db/pfam_mapping.json 可读。 + ## 9. 构建实测记录（执行 agent 回填） | 环境 | conda-pack 时长 | tar 体积 | 解包+unpack 时长 | 最终镜像体积 | 构建总时长 | 验证结果 |