admin/PlantAI-rag-new
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11 Commits
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admin d9abd0b86a feat(auth): 用户端鉴权(登录/授权清单/逐次校验/功能门禁 + owner 数据隔离) 2026-10-16 14:42:23 +08:00
admin 282415fcb1 feat(admin): 行为日志记录 hub_id(便于区分不同中枢) 2026-10-15 23:56:42 +08:00
admin c78df3a6a6 feat(admin): 新增管理后台(登录/用户管理/日志查看) + 行为日志文件采集(请求中间件 + log_event) 2026-10-15 18:43:19 +08:00
potaser d43d30ee3f feat: add review_service with plant genomics presubmit, journals endpoint, and BFF proxy 2026-10-09 16:54:03 +08:00
admin 91f6a1c242 feat: 新增论文撰写功能 paper-writer（独立 MCP 服务 + BFF 大脑 + 前端三卡） 
- paper_writer_service(8097)：FastAPI + MCP streamable-http 单端点，9 工具
  （propose_paper_outline/write_paper_section/get_paper_progress/search_refs/
  revise_paper_section/revise_paper/get_paper/complete_paper/cancel_paper），
  SQLite 三表（papers/paper_sections/citations，WAL），GB/T 7714 引用协议
- BFF：services/paper/{mcp_client,agent}.py（裸 JSON-RPC 客户端 + 规则状态机）、
  routers/paper.py、schemas.py 4 个 Paper*Block + ArtifactBlock 加 paper_id/citation_count、
  config.py 开关、main.py 条件注册、docgen.py 抽 insert_artifact 公共 helper
- 前端：intent.js paperIntent 纯函数、Composer docgen 分支 sub-route、sendPaper/轮询、
  PaperBriefCard/PaperOutlineCard/PaperProgressCard、DocPane cite-chip
- deploy/paper_restart.sh + toggle_paper.sh；compile_sdk.sh 白名单追加 paper 文件
- tests/paper 26 条（工具逻辑 + MCP 协议 + BFF 状态机 + 块 schema + 前端 intent 单测）
 2026-09-30 22:29:22 +08:00
adminandClaude Fable 5 e783a26be6 feat(priv): A1 实现私有资料问答 P1-P3——vstore chunk 索引 + BFF 私有问答端点 + 前端并行块与管理界面 
- P1 vstore: chunks.py 切块(600字/8段/重叠1/上限200,表格原位聚合,outline
  不参与)+ChunkIndex 三文件原子写+无降级档;embed_batch_chunked 批量16x并发4;
  vault add/delete/rebuild_chunks 钩子(chunk 失败不阻断 doc 级);search-chunks/
  rebuild-chunks 端点+health chunk_count;rebuild CLI
- P2 BFF: privateqa.ask_private(同doc≤3去重/12k截断/40s超时/带引用短答);
  POST /api/qa/private 三态;schemas PrivateDocBlock 入 union;client.search_chunks;
  llm timeout 参数;main.py 注册
- P3 前端: _firePrivate 并行检索+竞态防护(pending/flush/防重入/跨轮归属);
  AssistantMessage private_doc 块;i18n/private.js;PrivateLibraryPane 挂 DocPane
  空态;removeLibrary(204 兜底)

自测: vstore pytest 26/27(1 失败为 T1 骨架笔误待修)+74 回归;前端 vitest
373/373;npm run build 0 error;sdk 222 passed(3 failed 为基线预存);红线 diff 空。

Co-Authored-By: Claude Fable 5 <noreply@anthropic.com>
 2026-09-07 22:22:22 +08:00
adminandClaude Fable 5 b0c802095c feat(bioflow): P1 生信服务地基——bioflow_service 8098 独立部署树(12 服务模块+3 路由层+SQLite 三表+166 用例全绿)+BFF 流式反代/报告登记(BIOFLOW_ENABLED 开关默认关) 
Co-Authored-By: Claude Fable 5 <noreply@anthropic.com>
 2026-09-06 05:36:10 +08:00
jerryandClaude Fable 5 5db3ead73e feat(docgen): doc_writer 能力全链——vstore 独立服务 + BFF docgen 路由 + 前端文档工作台 
- vstore 独立安装包(8094):解析/嵌入/加密 vault/faiss 检索,存储路径支持本地 file 与 http(s):// URL,启动握手校验,集群化预留(embed 独立模块)
- BFF docgen 路由:上传入库/generate/编辑/导出/下载/主库管理,意图护栏(与前端同词典),vstore 失败兜底,quota 507 与 TTL 惰性清理
- 前端:自然触发意图路由、拖拽上传 chips、能力徽标、右侧文档 TAB(WYSIWYG 编辑/prompt 修改/PDF+DOCX 导出下载)、右栏拖宽+手柄仿左栏
- 批量导入工具 docgen_import.py(并发 8、导入即加密+删源明文)

Co-Authored-By: Claude Fable 5 <noreply@anthropic.com>
 2026-09-03 21:13:37 +08:00
jerryandClaude Fable 5 cd7e98e7c7 feat(capabilities): S4 SDK+UI 能力端点+Humanizer+设置面板(含 S3 发布修复) 
- sdk/services/capabilities.py: MANIFEST+DEFAULTS+sanitize+QA 注册表合并
- sdk/services/humanizer.py: 9 类中文 AI 痕迹规则(块级保护引用/表格/代码/图片)
- sdk/routers/capabilities.py: GET /api/capabilities + POST install 透传
- sdk/schemas.py+sessions.py: SessionMeta.capabilities + PATCH meta 白名单 merge
- sdk/routers/qa.py: humanize 会话开关注入 SSE;chat.js: body 加 session_id
- sse_relay.py: humanize_enabled 参数链(修 _pump_events 可见性编译错误)
- api.py(QA): /capabilities/registry loopback(BFF 合并)
- ui: settings store+SettingsPanel+AppShell 接线+SessionPanel 展开态设置入口+labels
- 测试: humanizer 8 用例+capabilities_svc 6 用例;SDK 146 全绿;UI vitest 172 全绿

Co-Authored-By: Claude Fable 5 <noreply@anthropic.com>
 2026-09-02 16:50:54 +08:00
jerryandClaude Fable 5 30b01b8ae1 P4/M5: SDK legacy 健康键 + 代理路由,五上游全绿 
- config.py rag_legacy_base_url=7910(默认)/ upstream.py legacy 键入 probe_all
- routers/legacy.py:13 族前缀白名单透明代理(线程池阻塞调用)
- 浸泡:sdk/.env RAG_LEGACY_BASE_URL=7911(agent/legacy-rag 编译树)
- 验证:经 BFF 代理 kg/stats+kg/families 200,非白名单 404

Co-Authored-By: Claude Fable 5 <noreply@anthropic.com>
 2026-08-31 15:58:47 +08:00
jerryandClaude Fable 5 0875bb036c P0/M1: 四部分重构——frontend→ui、backend→sdk 改名 + 引用修复 + 骨架 
- git mv 保留历史：ui/(Vue3+Vite)、sdk/(BFF 中间层)
- 路径语义修正：db_path/figures_cache 改相对 sdk/(BFF cwd)，
  历史库 sdk/backend/data 迁移至 sdk/data/(会话/图片缓存无损)
- 引用修复 ~15 处：config.py、deploy/*.sh、vitest/playwright 配置、
  单测导入路径、docs、README、gitignore、.env.example
- 骨架：agent/{qa,methodology,legacy-rag,vendor}、knowledge/manifest.yaml、
  tooling/{compile,kb,crypto,assemble,audit,tools,scripts} + README
- 门禁验证：sdk pytest 125 通过、ui vitest 158 通过、
  生产 BFF 脚本重启四上游全绿 + 静态托管 + 会话库无损

Co-Authored-By: Claude Fable 5 <noreply@anthropic.com>
 2026-08-31 12:56:47 +08:00