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adminandClaude Fable 5 f10b86c088 feat(deploy): start_all 生信段尊重 BIOFLOW_ENABLED(默认 false=无生信版) 
- 176 默认(含开机自启 plantai-apps.service)即为无生信启动版:
  BIOFLOW_ENABLED=false 时 start_all 不拉起 8098,生信 TAB/入口不可见
- 开关来自 sdk/.env,切回生信版=bash toggle_bioflow_176.sh on

Co-Authored-By: Claude Fable 5 <noreply@anthropic.com>
 2026-09-17 07:56:49 +08:00
admin afa7cce938 feat(aqua): unlock normalized KB identity via env with plant fallback 
- normalized_release EXPECTED_RELEASE defaults to NORMALIZED_RELEASE_ID (plant value)
- from_env falls back to constant on empty env; backend_guard uses env-or-constant
- start.sh sources env/active_library.env after prod.env (qa + legacy-rag)
- build_all.sh --library <name|dir> renders library identity (no name whitelist)
- add kb-libraries skeleton (plant/aqua identity cards) and tooling/aqua_kb
Co-Authored-By: Claude Fable 5 <noreply@anthropic.com>
 2026-09-12 19:10:08 +08:00
adminandClaude Fable 5 36fc2a7250 fix(statusbar): 生信任务活跃期回退消息列表点亮 4 点 
生产实测暴露缺口:生信对话的 chat/stream 在 plan_ready 后即关闭
(_finishCtx 清 streamCtx→currentMessage 为 null),而任务阶段恰在
流关闭后才真正运行——StatusBar 只读 currentMessage,阶段运行期
间 4 点仍不亮。这正是用户报的 bug 主场景。

- chat.js 新增 agentDotMessage getter:优先流式中 currentMessage;
  流已收口时回退到消息列表里持有活跃生信任务(progress.jobId 且
  jobStatus ∈ created/running/paused)的最后一条助手消息——其派生
  pipeline 块正被任务事件订阅(connectJobEvents onEvent →
  patchBioflowEvent → syncBioflowDotBlock)持续刷新。
- StatusBar.vue 数据源换 agentDotMessage;TopBar.vue runningPhaseOf
  同换 + aggregate 在生信任务活跃期(busy=false 但有 running 相位)
  点亮聚合点。
- 单测补生产实测场景:流已收口任务活跃→回退点亮;阶段推进随动;
  任务终态正确收口空态。

验证:r3debug 89/89(新增回退用例)、主套件 373/373、dist 重建。

Co-Authored-By: Claude Fable 5 <noreply@anthropic.com>
 2026-09-12 18:22:03 +08:00
adminandClaude Fable 5 9d7ed1bdd3 feat(deploy): start_all.sh 编排生信服务(存在则启动/重启) 
2026-09-12 陷阱 6:176 整机重启后 start_all 只拉五服务,独立树
bioflow_service(8098)掉进程无告警——生信 TAB 静默消失
(TAB 显隐由 /api/bioflow/health 轮询驱动)。

- start_all 模板新增生信编排段:探测 install 同级
  bioflow/bioflow_service/restart.sh,存在则启动/重启并
  8098 探活(restart.sh 自带旧进程 kill+重启语义),不存在
  跳过;失败不阻断主服务。
- DEPLOY_FLOW §5.1 同步:生信首次部署与新机自动拉起区分。

验证:build_all.sh bash -n OK;生成的 start_all.sh 从 heredoc
提取后 bash -n OK。

Co-Authored-By: Claude Fable 5 <noreply@anthropic.com>
 2026-09-12 16:55:47 +08:00
adminandClaude Fable 5 a57c1994e8 feat(deploy): 176 部署完成与启动脚本可移植化 
- start.sh×3: venv 解析改为安装包内 ../venv 优先(175 旧路径回退), 176 等目标机免改
- build_all.sh: start_all 模板补 vstore 拉起 + BFF 前 source sdk/.env + PYBIN 可移植解析 + env 目录 mkdir
- DEPLOY_FLOW.md: §5.1 重写(176 实战模板: venv/torch 安装顺序/.env 键/ollama 离线携带/下载源可达性/内网直连), §0 增 176 已部署行

Co-Authored-By: Claude Fable 5 <noreply@anthropic.com>
 2026-09-09 01:01:30 +08:00
adminandClaude Fable 5 e151f675f1 feat(qa-db): QA数据库裸进程标准(deploy/qa-db五脚本+守卫去版本锁定+打包/文档/Excel同步) 
- deploy/qa-db/: qdrant/neo4j systemd 裸进程安装脚本+unit模板+整库替换(replace_db.sh)
  * 数据双制品模型: <部署根>/qa-db 与 install 分开传输, 支持频繁整库替换
  * 免编译(官方静态二进制/tarball)+本地 bin/ 离线分发+国内镜像回退
  * 端口 27433/27434+19888/19885(127.0.0.1), 175 docker 容器(27333/19788)为其他项目共享不动
- backend_guard.py: 移除精确计数相等校验(数据库会整库替换/持续更新, 不得锁死版本)
  保留身份校验(release/collection/kb_version/标签/关系类型), 计数仅随 health 返回
- qa/scripts/start.sh: reranker 模型路径回退(install/models/bge-reranker-base)
- build_all.sh: qa-db 脚本+reranker 模型入包; .gitignore: qa-db/bin 离线载体
- DEPLOY_FLOW.md: §0/§5.0/§5.0b/§6.0b/§7 QA 数据库裸进程标准

Co-Authored-By: Claude Fable 5 <noreply@anthropic.com>
 2026-09-08 17:59:53 +08:00
adminandClaude Fable 5 acf5b734fa feat(deploy): nginx 80 端口代理章节+模板+BFF 改绑 127.0.0.1(仅新增修改,未真实部署) 
- deploy/nginx/plantai.conf(新): 80 反代 127.0.0.1:8090 模板,SSE 长连接
  (buffering off/read_timeout 3600s>看门狗 1200s)+大文件上传
  (client_max_body_size 0/request_buffering off/send_timeout 600s)适配
- 绑定脚本: bff_restart.sh/sdk/run.sh/start-dev.sh 默认 0.0.0.0→127.0.0.1
  (nginx 80 为唯一客户入口);build_all.sh start_all heredoc 同改+nginx
  模板入包 install/nginx/
- DEPLOY_FLOW.md: §0 绑定策略更新+nginx 模板位置;新增 §5b 从零安装
  nginx(apt/yum 探测→放模板→nginx -t→启用→防火墙→先 nginx 后改绑的
  切换顺序→内网验证);§6 质检增 nginx 专项(进程/80 监听/经 80 首页+SSE
  冒烟+上传冒烟);§7 注明现网仍是 0.0.0.0:8090 直连形态待按 §5b 迁移

纪律: 仅新增与修改,未在目标机/现网执行任何 nginx 安装或改绑操作。

Co-Authored-By: Claude Fable 5 <noreply@anthropic.com>
 2026-09-08 15:15:21 +08:00
adminandClaude Fable 5 7b63765d69 chore(deploy): vstore 编译硬化纳入打包流水线——目标机不再出现向量库明文代码 
- tooling/compile/compile_vstore.sh(新): 复制 compile_sdk.sh 改白名单
  (api.py 入口明文+__init__.py,其余 12 模块 Cython .so+strip+elf 校验)
- build_all.sh: 编译段追加 vstore 编译(SDK_PYTHON);冒烟段追加 import 检查;
  组装段改复制编译产物(此前复制明文源码)
- 实测: 编译 12 .so 成功;冒烟 health+search-chunks 正常;bash -n 过

Co-Authored-By: Claude Fable 5 <noreply@anthropic.com>
 2026-09-08 01:25:44 +08:00
adminandClaude Fable 5 dbe2037116 chore(deploy): 向量化本地模型(Ollama+bge-m3)纳入部署脚本 
- deploy/ollama_restart.sh(新): Ollama 幂等拉起+嵌入模型校验,二进制多候选
  探测(零硬编码),模型缺失只告警不阻断;start_all.sh 在四服务前先拉起
- vstore/vstore_restart.sh(新): 部署树与安装包共用版(路径从脚本位置推导,
  零硬编码),替换部署树旧硬编码脚本(实测重启后 210 文档+210 chunks 完整)
- build_all.sh: 组装段纳入 vstore 明文源码+启动脚本+env 模板;start_all.sh
  heredoc 增加 Ollama 拉起段——安装包自此包含向量化环节

实测: ollama_restart.sh 幂等(已运行跳过,bge-m3 就绪);vstore 新脚本重启
UP(210/210);bash -n 全过。

Co-Authored-By: Claude Fable 5 <noreply@anthropic.com>
 2026-09-08 00:46:31 +08:00
jerryandClaude Fable 5 4071b29520 Python 统一 U0-U4:venv py3.12.13 + 四树 cp312 重编译 + 端口互换 8091/8092/8093 + 旧服务停而不删 
- U0:新建 plantai-rag-new-venv(3.12.13,130 包),torch 2.13.0+cpu/cython 3.2.8/faiss 1.14.3/openai 3.3.1,requirements.lock 固化
- U1:四树全 venv 重编译(sdk 15/qa 45/methodology 28/legacy 283 .so 全 cp312),audit 双审计过
- U2:备用端口影子对照:金标 search evidence 30/30 与生产一致、SDK pytest 125 过、五上游绿
- U3:统一树切终态 8091/8092/8093 + BFF 8090(venv),停旧服务(容器/进程不删,30 天窗)
- U4:minerupy311→minerupy312 断链修复、GF_PYTHON_ENV 回退统一、start-dev/run/bff_restart 去 conda、server.env/README 更新

Co-Authored-By: Claude Fable 5 <noreply@anthropic.com>
 2026-09-01 12:23:37 +08:00
jerryandClaude Fable 5 84d2511f62 P6/M7: compile_sdk.sh + build_all.sh 一键打包流水线 
- compile_sdk.sh:SDK 编译硬化(15 .so;白名单 main/config/schemas——schemas 为
  pydantic v2 validator 被 Cython 转 cyfunction 触发 PydanticUserError,实测豁免)
- 编译树 SDK 冒烟:audit 0 错,8094 起真实 BFF 五上游全绿
- build_all.sh:编译 4 树 → 双审计 → import 冒烟 → (SKIP_KB=1 跳过 KB,
  定版后置 0)→ 组装安装目录 + start_all.sh → SHA256SUMS → 泄露门禁
- tooling.env:新工程路径与端口终态(8090 段)

Co-Authored-By: Claude Fable 5 <noreply@anthropic.com>
 2026-08-31 17:16:03 +08:00