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jerryandClaude Fable 5 9f5b38c203 P3/M4: methodology 编译树切换(BFF rag→8001,回滚窗口开启) 
Co-Authored-By: Claude Fable 5 <noreply@anthropic.com>
 2026-08-31 13:53:47 +08:00
jerryandClaude Fable 5 28b497354e P3/M4: agent/methodology 源码导入(16K 行)+ 影子 8001 冒烟 
- src/rag/{unified(21模块),extractors/methodology,project_config} + api/methodology_routes.py(998行)
- 新薄入口 scripts/methodology_server.py(/health + /api/v1/methodology/*)
- env 化补丁:UPLOAD_JOBS_DIR/UPLOAD_OUTPUT_ROOT 支持 env 覆盖(数据根迁移免改代码)
- 影子 8001 冒烟:job 列表与生产 8000 完全一致(3/3)

Co-Authored-By: Claude Fable 5 <noreply@anthropic.com>
 2026-08-31 13:47:12 +08:00
jerry 0da658e276 P2/M3: 浸泡记录补 KG overview 慢查询观察 2026-08-31 13:44:04 +08:00
jerryandClaude Fable 5 2e6dcd98d7 P2/M3: 浸泡切换部署完成(BFF→agent/qa 编译树 7921,回滚窗口开启) 
Co-Authored-By: Claude Fable 5 <noreply@anthropic.com>
 2026-08-31 13:37:49 +08:00
jerryandClaude Fable 5 352ef8e1ec P2/M3: bff_restart.sh 修 pkill 模式(python -m uvicorn 形态)+ 启动等待 5s→12s 
- 旧模式 [u]vicorn app.main:app 匹配不到 python -m uvicorn 命令行
- 编译树 BFF 冷启动更慢,等待窗口放宽
- 浸泡切换:sdk/.env QA_BASE_URL=7921(agent/qa 编译树),回滚=删行+重启

Co-Authored-By: Claude Fable 5 <noreply@anthropic.com>
 2026-08-31 13:33:20 +08:00
jerryandClaude Fable 5 b813cff005 P1/M2: tooling/compile/compile_qa.sh(参数化 + normalized_release 补丁) 
- 收编工具链遗漏主项目 08-29 新增 src/rag/normalized_release.py(backend_guard 依赖)
- 编译树 45 模块全部 .so,audit 0 错误,7922 健康检查金标过
- 修复:compile 目录相对依赖 tools/(elf_visibility.py)

Co-Authored-By: Claude Fable 5 <noreply@anthropic.com>
 2026-08-31 13:26:18 +08:00
jerryandClaude Fable 5 8327735821 P1/M2: agent/qa 影子冒烟金标全过(evidence 30/30 与生产一致) 
Co-Authored-By: Claude Fable 5 <noreply@anthropic.com>
 2026-08-31 13:15:12 +08:00
jerryandClaude Fable 5 e6efb2bd7a P1/M2: agent/qa 源码导入(主项目 d46d02c) 
- src/rag/{qa_v1_1_73(41模块),retrieval,dual_kb_taxonomy_rag/entity_alias,normalized_release} = 18.3K 行
- 入口 scripts/qa_v1_1_73_server.py + 4 个 config yaml + requirements
- scripts/{start,stop,status,restart}.sh(端口参数化,影子 7921/生产 7920)
- env/prod.env(容器同源凭据,gitignored) + prod.env.example(占位符)

Co-Authored-By: Claude Fable 5 <noreply@anthropic.com>
 2026-08-31 13:03:38 +08:00
jerryandClaude Fable 5 27946edc2b P0/M1: 收编 encryption-test 工具链入 tooling/ 
- legacy_plantai_server_package/: phase_a–f + compile_* + bin/plantai_admin.py
  + tools/(audit/elf_visibility/smoke/build_delivery_manifest) 完整基线
- legacy_docker_packager/: protected 形态参考
- crypto/client/: plantai_core.py(AES-GCM 原语) + install_plantai.sh 参考
- secrets/provision 严格排除(gitignore),入 git 前已脱敏清理
- LEGACY_MAPPING.md 记录源与改造方向

Co-Authored-By: Claude Fable 5 <noreply@anthropic.com>
 2026-08-31 12:59:29 +08:00
jerryandClaude Fable 5 0875bb036c P0/M1: 四部分重构——frontend→ui、backend→sdk 改名 + 引用修复 + 骨架 
- git mv 保留历史：ui/(Vue3+Vite)、sdk/(BFF 中间层)
- 路径语义修正：db_path/figures_cache 改相对 sdk/(BFF cwd)，
  历史库 sdk/backend/data 迁移至 sdk/data/(会话/图片缓存无损)
- 引用修复 ~15 处：config.py、deploy/*.sh、vitest/playwright 配置、
  单测导入路径、docs、README、gitignore、.env.example
- 骨架：agent/{qa,methodology,legacy-rag,vendor}、knowledge/manifest.yaml、
  tooling/{compile,kb,crypto,assemble,audit,tools,scripts} + README
- 门禁验证：sdk pytest 125 通过、ui vitest 158 通过、
  生产 BFF 脚本重启四上游全绿 + 静态托管 + 会话库无损

Co-Authored-By: Claude Fable 5 <noreply@anthropic.com>
 2026-08-31 12:56:47 +08:00
jerry 71189567ee refactor(figures): 图片与 registry 路径改指 teamWorkspace 主项目(去旧根依赖) 2026-08-29 19:38:13 +08:00
jerryandClaude Fable 5 bb2b5b5f71 图文并茂长篇回复 + 多流重构 + 品牌与性能优化 
- 长文答案：上游 QA 镜像 prompt 改造（5000 字目标 + [[FIG:PMCID]] 图片标记 + max_tokens 12000 + LLM 超时 300s），docker commit 新镜像（回滚锚点 :20260828-orig）
- 图片服务：BFF figures 路由（本地 MinerU 索引 + Europe PMC 解析含许可 + 图片代理带磁盘缓存），答案 markdown 注入图注块（标记替换 + PMID 兜底 + 上限 8 张）
- 前端图文渲染：figure 图注块 + 点击放大遮罩 + lazy 加载 + 加载失败隐藏
- 多流重构：切换会话不再中断，每会话独立流上下文后台继续（修复 Pinia 代理相等陷阱）
- 证据量回调：ablation 恢复上游默认（top_k 30 / graph_min 15）支撑长文
- 品牌：海古纪 logo 图片 + 站点 icon + 标题更新
- 性能：Aurora 静态化、shimmer/sweep 改 transform、pulse 改透明度呼吸、autoGrow rAF 批处理
- 看门狗适配长文：STREAM_IDLE_TIMEOUT 240s → 1200s
- 运维：neo4j_recreate.sh 固化、sync.sh 公网地址、m5 超时 900s
- 测试：后端 125 测 / 前端 158 测全过；端到端实测 9938 字 + 17 小节 + 8 图

Co-Authored-By: Claude Fable 5 <noreply@anthropic.com>
 2026-08-28 23:27:18 +08:00
jerry f456969a45 清理 .DS_Store 并加入忽略 2026-08-25 20:57:20 +08:00
jerryandClaude Fable 5 1e94de7464 PlantAI-rag-new 首次提交：文献知识工作台 
- BFF 薄适配层（FastAPI，8090）：QA 代理/SSE 中继/Neo4j 直连/抽取代理/会话持久化
- Vue3 前端：五相位检索流水线、文献来源与证据链、知识图谱、提取任务四 tab
- 四档响应式（桌面/笔记本/平板/手机）、深浅主题
- 81 个 FR 全部实现，测试追溯矩阵 81/81，后端 121 测/前端 156 测
- 真实凭据已脱敏，运行时配置在 backend/.env（不入 git）

Co-Authored-By: Claude Fable 5 <noreply@anthropic.com>
 2026-08-25 20:47:52 +08:00