jerryandClaude Fable 5 2f82c4a8dc P4/M5: agent/legacy-rag 源码迁移(449 模块 191K 行)+ 影子 7911/7912 冒烟 ...

- 按生产 7900 容器黄金清单迁移(compile.manifest 449 条目,0 缺失)
- 入口双态:api.app(生产同源 3 路由)/ api.main(裁剪 11 路由族 91 路径)
- 修复:advanced/__init__ 空文件(包标记误覆盖,已从主项目恢复)
- 修复:api/rag_routes.py 跨环境 site-packages 注入改 LEGACY_GF_SITE_PACKAGES 门控
- 修复:scripts/utils 缺失(动态加载 reasoning_engine)
- 影子验证:kg/stats 数据连通(6.2s,与 7900 同源 normalized 后端)

Co-Authored-By: Claude Fable 5 <noreply@anthropic.com>

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add_missing_genes.py

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apply_locus_mapping.py

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chunk_by_section.py

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expand_expression_relations.py

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expand_selective.py

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fetch_supplementary_data.py

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final_merge_and_eval.py

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final_merge_v2.py

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final_merge_v3.py

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generate_validation_report.py

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kg_sqlite.py

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merge_all_extractions.py

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post_process_aggressive.py

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post_process_filter.py

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reasoning_engine.py

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universal_supplementary_fetcher.py

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validate_extraction.py

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