# 基因提取质量验证指南

> 生成时间: 2026-04-02

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## 📋 验证样本 (9个基因)

| 序号 | 基因ID | 家族 | 物种 | 分组 | PDF来源 |
|:---:|:---|:---|:---|:---|:---|
| 1 | CYP85A1 | P450 | Solanum lycopersicum | Non_Aryan | 番茄p450 |
| 2 | TCP34 | TCP | Panicum virgatum | Class_II | 柳枝稷TCP |
| 3 | MADS38 | MADS | Citrullus lanatus | MIKC | 西瓜MADS |
| 4 | ERF105 | AP2-EREBP | Oryza sativa | Group_C | 短柄AP2 |
| 5 | ERF013 | AP2-EREBP | Oryza sativa | Group_A | 短柄AP2 |
| 6 | SPL9 | SPL | Fagopyrum tataricum | Group_B | 苦荞SPL |
| 7 | AG | MADS | Citrullus lanatus | Type_II | 西瓜MADS |
| 8 | IQD5 | IQD Protein | Brassica rapa | Group_I | 白菜IQD |
| 9 | IQD16 | IQD Protein | Brassica rapa | Group_II | 白菜IQD |

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## 🔍 验证步骤

### 1. 找到对应PDF
根据"PDF来源"列找到对应的PDF文件：
- 番茄p450 → `paper/ceshi/番茄p450基因家族BMCgenomics2020.pdf`
- 柳枝稷TCP → `paper/ceshi/柳枝稷TCP基因家族...`
- 西瓜MADS → `paper/ceshi/西瓜MADSwang2019.pdf`
- 短柄AP2 → `paper/ceshi/短柄AP2s12864-016-2968-8.pdf`
- 苦荞SPL → `paper/ceshi/1pianV2/苦荞SPL2019...`
- 白菜IQD → `paper/ceshi/白菜IQDyuan2019.pdf`

### 2. 打开PDF搜索基因
使用PDF阅读器的搜索功能，搜索基因ID (如: CYP85A1)

### 3. 验证三个属性
找到基因后，验证：
- **家族**: 该基因是否属于标注的家族？
- **物种**: 该基因是否来自标注的物种？
- **分组**: 该基因是否属于标注的分组？

### 4. 记录验证结果
在下方表格记录：
- ✓ = 正确
- ✗ = 错误
- ? = 不确定/未找到

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## 📝 验证记录表

| 序号 | 基因ID | 家族[✓/✗/?] | 物种[✓/✗/?] | 分组[✓/✗/?] | 备注 |
|:---:|:---|:---:|:---:|:---:|:---|
| 1 | CYP85A1 | [ ] | [ ] | [ ] | |
| 2 | TCP34 | [ ] | [ ] | [ ] | |
| 3 | MADS38 | [ ] | [ ] | [ ] | |
| 4 | ERF105 | [ ] | [ ] | [ ] | |
| 5 | ERF013 | [ ] | [ ] | [ ] | |
| 6 | SPL9 | [ ] | [ ] | [ ] | |
| 7 | AG | [ ] | [ ] | [ ] | |
| 8 | IQD5 | [ ] | [ ] | [ ] | |
| 9 | IQD16 | [ ] | [ ] | [ ] | |

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## 📊 统计

- 总验证数: 9个基因 × 3个属性 = 27项
- 正确数: ___ 项
- 错误数: ___ 项
- 不确定: ___ 项
- **准确率**: ___ %

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## 💡 验证技巧

1. **基因家族验证**: 查看基因ID前缀
   - CYP* → P450家族
   - TCP* → TCP家族
   - SPL* → SPL家族
   - ERF* → AP2-EREBP家族

2. **物种验证**: 查看论文标题或摘要中的物种名称

3. **分组验证**: 查看系统发育树或表格中的分组信息
   - 通常Group A/B/C或Class I/II

4. **快速验证**: 如果基因ID前缀与家族匹配，大概率正确

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## ⚠️ 注意事项

- 有些基因可能在补充材料中，主文档可能找不到
- 分组信息可能在系统发育树图中，需要查看图片
- 如果找不到，标记为"?不确定"
- 重点关注家族和物种，分组可作为参考

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*验证完成后，请更新准确率统计*