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10天交付计划 (4月1日-4月10日)
目标: 完整版基因家族知识图谱系统 当前日期: 4月2日 (剩余9天)
📊 当前状态 (4月2日 01:30)
已完成 ✅
| 模块 | 状态 | 说明 |
|---|---|---|
| v5.2提取器 | ✅ | 审查机制已修复 |
| 批量处理 | ✅ | 支持8篇论文批量提取 |
| 知识图谱Schema | ✅ | 6实体+8关系定义 |
| 基础导入 | ✅ | 376基因+15分组已导入 |
| 审查机制 | ✅ | 4轮审查+过滤生效 |
待完成 ⏳
| 模块 | 优先级 | 工作量 |
|---|---|---|
| 完整实体类型(19种) | P1 | 3天 |
| 完整关系类型(30种) | P1 | 3天 |
| 实体提取器 | P0 | 2天 |
| 关系抽取器 | P0 | 2天 |
| API接口 | P0 | 1天 |
| 前端展示 | P1 | 2天 |
| 测试验证 | P0 | 1天 |
🎯 交付目标
核心交付物
- 知识图谱: 19实体类型 + 30关系类型
- 提取系统: 从PDF自动提取实体和关系
- API服务: 查询、导入、统计接口
- 前端界面: 知识图谱可视化展示
- 测试报告: 准确率、覆盖率验证
数据规模目标
- 基因家族: 118个 (已有)
- 基因: 1000+ (当前376)
- 实体: 5000+ (当前518)
- 关系: 10000+ (当前1134)
📅 详细日程 (剩余9天)
Day 2 (4月2日 周二) - 实体扩展
上午 (3h)
- 扩展kg_schema.py到19实体类型
- 添加: protein, phenotype, treatment, metabolite
- 添加: tissue, process, pathway, hormone
- 添加: mirna, motif, database, tool, stage
- 添加: condition, cellular_component, molecular_function
下午 (3h)
- 实现实体提取器
- 基于v5.2提取框架
- 添加实体识别正则表达式
- 测试提取准确性
晚上 (2h)
- 批量提取10篇论文
- 验证实体提取质量
- 修复提取bug
交付物: 19实体类型定义 + 实体提取器
Day 3 (4月3日 周三) - 关系扩展
上午 (3h)
- 扩展kg_schema.py到30关系类型
- 调控关系: represses, activates, upregulates...
- 表达关系: expressed_in, highly_expressed_in...
- 参与关系: involved_in, participates_in...
- 互作关系: interacts_with, binds_to, targets
下午 (3h)
- 实现关系抽取器
- 基于规则的关系提取
- 关系方向识别
- 置信度评估
晚上 (2h)
- 批量提取关系
- 验证关系质量
- 修复关系抽取bug
交付物: 30关系类型定义 + 关系抽取器
Day 4 (4月4日 周四) - 导入优化
上午 (3h)
- 优化kg_import.py
- 支持批量导入19实体
- 支持批量导入30关系
- 添加事务处理
下午 (3h)
- 处理50篇论文
- 批量提取实体和关系
- 自动导入知识图谱
- 生成导入报告
晚上 (2h)
- 验证知识图谱规模
- 统计实体数量
- 统计关系数量
- 检查覆盖率
交付物: 完整导入系统 + 50篇论文数据
Day 5 (4月5日 周五) - API开发
上午 (3h)
- 开发知识图谱API
- POST /kg/entities (实体查询)
- POST /kg/relations (关系查询)
- POST /kg/import (批量导入)
- GET /kg/stats (统计信息)
下午 (3h)
- 开发高级查询API
- POST /kg/query (Cypher查询)
- POST /kg/path (路径查询)
- POST /kg/neighbors (邻居查询)
晚上 (2h)
- API测试
- 接口功能测试
- 性能测试
- 错误处理测试
交付物: 完整API接口 + 测试用例
Day 6 (4月6日 周六) - 前端开发
上午 (3h)
- 开发知识图谱可视化组件
- 使用D3.js或ECharts
- 节点和关系展示
- 交互式探索
下午 (3h)
- 开发查询界面
- 实体搜索框
- 关系筛选器
- 查询结果展示
晚上 (2h)
- 集成到现有前端
- 添加知识图谱页面
- 与对话界面集成
- 样式统一
交付物: 前端可视化界面
Day 7 (4月7日 周日) - 数据处理
上午 (3h)
- 处理剩余论文
- 目标: 100篇论文
- 批量提取和导入
- 错误处理和重试
下午 (3h)
- 数据清洗
- 去重处理
- 格式标准化
- 缺失值处理
晚上 (2h)
- 生成最终数据集
- 导出知识图谱
- 生成统计报告
- 备份数据
交付物: 100篇论文数据 + 清洗后知识图谱
Day 8 (4月8日 周一) - 测试验证
上午 (3h)
- 功能测试
- 实体提取准确率
- 关系抽取准确率
- API接口测试
下午 (3h)
- 性能测试
- 查询响应时间
- 并发处理能力
- 大数据量测试
晚上 (2h)
- 修复bug
- 修复测试发现的问题
- 优化性能瓶颈
- 完善错误处理
交付物: 测试报告 + bug修复
Day 9 (4月9日 周二) - 文档完善
上午 (3h)
- 编写技术文档
- API文档
- 架构设计文档
- 部署文档
下午 (3h)
- 编写用户文档
- 使用手册
- 示例教程
- FAQ
晚上 (2h)
- 整理项目
- 代码清理
- 文件归档
- 版本标记
交付物: 完整文档 + 清理后的代码
Day 10 (4月10日 周三) - 交付准备
上午 (3h)
- 最终测试
- 端到端测试
- 集成测试
- 验收测试
下午 (3h)
- 部署准备
- Docker镜像构建
- 配置文件准备
- 部署脚本编写
晚上 (2h)
- 交付检查
- 功能完整性检查
- 文档完整性检查
- 代码质量检查
交付物: 可部署系统 + 交付文档
📋 每日检查清单
每天早上 (5分钟)
- 检查昨日任务完成情况
- 确认今日任务优先级
- 识别阻塞问题
每天晚上 (10分钟)
- 记录今日完成内容
- 更新任务状态
- 规划明日任务
🚨 风险管控
| 风险 | 概率 | 影响 | 应对策略 |
|---|---|---|---|
| 实体提取不准确 | 中 | 高 | 加强规则+人工校验 |
| 关系抽取困难 | 高 | 高 | 先实现核心关系 |
| 时间不足 | 中 | 高 | 优先P0任务 |
| API性能问题 | 低 | 中 | 提前性能测试 |
✅ 成功标准
功能标准
- 19实体类型全部实现
- 30关系类型全部实现
- 支持100篇论文批量处理
- API响应时间<1s
- 前端可视化可用
数据标准
- 基因家族: 118个
- 基因: 1000+
- 实体: 5000+
- 关系: 10000+
质量标准
- 实体提取准确率>85%
- 关系抽取准确率>80%
- API可用性>99%
📞 沟通机制
- 每日同步: 晚上10分钟进度汇报
- 阻塞升级: 遇到问题立即沟通
- 计划调整: 根据实际情况灵活调整
计划制定: 2026-04-02 01:30 下次更新: 每日晚上