2.1 KiB
Executable File
2.1 KiB
Executable File
Gene-Family-MAS-V2 修订计划
修订原则
- 24小时不间断修订
- 不删除文件
- 实事求是，不编造
- 后端API测试真实数据
- 定时记录修订进度
最优方案 (基于分析)
方案选择: 借鉴autoSKG + PlantConnectome
autoSKG特点:
- 使用GROBID提取PDF文本
- 使用LLM构建知识图谱
- 输出为parquet格式
- 支持增量更新
PlantConnectome特点:
- 788个预定义关系词
- 字段完整性100%
- 证据溯源完整
我们的最优方案:
- PDF提取: 使用GROBID (autoSKG方式)
- 关系抽取: 使用OpenAI GPT-4o (PC方式)
- 关系词表: 选取PC的39个基因家族专用词
- 质量保证: 字段完整性+证据溯源
- 存储格式: JSON + SQLite (兼容现有)
修订任务清单
任务1: 配置OpenAI API (03:30前)
- 从.env读取API key
- 测试API连接
- 记录到revision_log
任务2: 修复V12.1章节提取 (03:50前)
- 检查当前章节保存逻辑
- 修复保存到结果文件
- 重新提取荔枝论文
- 验证章节完整性
任务3: 实现LLM关系抽取 (04:10前)
- 创建llm_extractor.py
- 使用GPT-4o抽取关系
- 从章节文本批量抽取
- 测试抽取质量
任务4: 扩展知识图谱 (持续)
- 添加39个关系词
- 实现基因家族特有词
- 添加basis字段
- 验证关系准确性
任务5: 真实数据验证 (持续)
- 后端API测试所有代码
- 验证抽取结果
- 记录验证日志
定时记录计划
| 时间 | 动作 | 内容 |
|---|---|---|
| 03:30 | 记录进度 | 任务1完成状态 |
| 03:50 | 记录进度 | 任务2完成状态 |
| 04:10 | 状态检查 | 检查修订是否在进行 |
| 每30分钟 | 心跳检测 | 检查任务运行状态 |
修订记录文件
/home/xia-lab/gene-family-mas-v2/revision_log_0330.md/home/xia-lab/gene-family-mas-v2/revision_log_0350.md/home/xia-lab/gene-family-mas-v2/revision_status.md
当前状态
开始时间: 2026-04-10 03:27 当前任务: 配置OpenAI API 下一步: 修复V12.1章节提取