PlantAI-rag/prompts/extraction_prompt_v2_2_relations.md

V2.2 第二阶段：关系提取

基于以下实体，从论文中提取关系信息。

已提取的实体：

{entities_list}

论文内容：

{chunk_text}

提取要求：

只提取以下关系类型：

1. [gene] expressed_in [tissue] - 基因在组织中表达
2. [gene] involved_in [phenotype] - 基因参与表型
3. [treatment] upregulates [gene] - 处理上调基因
4. [treatment] downregulates [gene] - 处理下调基因
5. [protein] contains [domain] - 蛋白质包含结构域

输出格式：

{
  "relations": [
    {
      "source": "源实体名称",
      "source_type": "源类型",
      "relationship": "关系动词",
      "target": "目标实体名称",
      "target_type": "目标类型",
      "basis": "提取依据（简短）"
    }
  ]
}

重要提示：

1. 只使用已提供的实体
2. 最多提取15个关系
3. 确保JSON完整
4. 简短描述

请输出JSON：