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基因提取质量验证指南
生成时间: 2026-04-02
📋 验证样本 (9个基因)
| 序号 | 基因ID | 家族 | 物种 | 分组 | PDF来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | CYP85A1 | P450 | Solanum lycopersicum | Non_Aryan | 番茄p450 |
| 2 | TCP34 | TCP | Panicum virgatum | Class_II | 柳枝稷TCP |
| 3 | MADS38 | MADS | Citrullus lanatus | MIKC | 西瓜MADS |
| 4 | ERF105 | AP2-EREBP | Oryza sativa | Group_C | 短柄AP2 |
| 5 | ERF013 | AP2-EREBP | Oryza sativa | Group_A | 短柄AP2 |
| 6 | SPL9 | SPL | Fagopyrum tataricum | Group_B | 苦荞SPL |
| 7 | AG | MADS | Citrullus lanatus | Type_II | 西瓜MADS |
| 8 | IQD5 | IQD Protein | Brassica rapa | Group_I | 白菜IQD |
| 9 | IQD16 | IQD Protein | Brassica rapa | Group_II | 白菜IQD |
🔍 验证步骤
1. 找到对应PDF
根据"PDF来源"列找到对应的PDF文件：
- 番茄p450 →
paper/ceshi/番茄p450基因家族BMCgenomics2020.pdf - 柳枝稷TCP →
paper/ceshi/柳枝稷TCP基因家族... - 西瓜MADS →
paper/ceshi/西瓜MADSwang2019.pdf - 短柄AP2 →
paper/ceshi/短柄AP2s12864-016-2968-8.pdf - 苦荞SPL →
paper/ceshi/1pianV2/苦荞SPL2019... - 白菜IQD →
paper/ceshi/白菜IQDyuan2019.pdf
2. 打开PDF搜索基因
使用PDF阅读器的搜索功能，搜索基因ID (如: CYP85A1)
3. 验证三个属性
找到基因后，验证：
- 家族: 该基因是否属于标注的家族？
- 物种: 该基因是否来自标注的物种？
- 分组: 该基因是否属于标注的分组？
4. 记录验证结果
在下方表格记录：
- ✓ = 正确
- ✗ = 错误
- ? = 不确定/未找到
📝 验证记录表
| 序号 | 基因ID | 家族[✓/✗/?] | 物种[✓/✗/?] | 分组[✓/✗/?] | 备注 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | CYP85A1 | [ ] | [ ] | [ ] | |
| 2 | TCP34 | [ ] | [ ] | [ ] | |
| 3 | MADS38 | [ ] | [ ] | [ ] | |
| 4 | ERF105 | [ ] | [ ] | [ ] | |
| 5 | ERF013 | [ ] | [ ] | [ ] | |
| 6 | SPL9 | [ ] | [ ] | [ ] | |
| 7 | AG | [ ] | [ ] | [ ] | |
| 8 | IQD5 | [ ] | [ ] | [ ] | |
| 9 | IQD16 | [ ] | [ ] | [ ] |
📊 统计
- 总验证数: 9个基因 × 3个属性 = 27项
- 正确数: ___ 项
- 错误数: ___ 项
- 不确定: ___ 项
- 准确率: ___ %
💡 验证技巧
-
基因家族验证: 查看基因ID前缀
- CYP* → P450家族
- TCP* → TCP家族
- SPL* → SPL家族
- ERF* → AP2-EREBP家族
-
物种验证: 查看论文标题或摘要中的物种名称
-
分组验证: 查看系统发育树或表格中的分组信息
- 通常Group A/B/C或Class I/II
-
快速验证: 如果基因ID前缀与家族匹配，大概率正确
⚠️ 注意事项
- 有些基因可能在补充材料中，主文档可能找不到
- 分组信息可能在系统发育树图中，需要查看图片
- 如果找不到，标记为"?不确定"
- 重点关注家族和物种，分组可作为参考
验证完成后，请更新准确率统计