admin 0282cfeeeb feat(bioflow): 阶段进度条+滚动日志+点击定位全链;图片注入三修;QA启动就绪等待 ...

- 生信进度:后端新增 stage_progress 事件帧+进度解析白名单(rnaseq_qc/sample_qc),
  kernel 日志流式落盘(20行/1s flush+fsync),logs 分页端点(offset/limit/eof),
  事件 seq 跨重启扫描续增(2026-09-17 断流修复);前端 FlowProgressCard 确定性/
  不确定两态进度条+点击定位到生信任务 TAB,BioJobsPane DAG 行展开滚动日志区
  (3s 轮询),log_tail 4000 截断,重跑 stage_started 清零进度
- 图片注入:figures 三源重构(标准DOI图库主路径/遗留体系兜底/PMC兜底),
  [[FIG:]] 宽松归一化识别 PMC/PMID/DOI 三种形态,引文兜底扩展至
  [PMCID:]/[DOI:] 且标记未满配额继续注入,注入预算 90s/10篇(175 实测校准),
  PMC graphic 无 content-type 宽松正则,空结果不缓存(176 冷连接三连败修复)
- QA 启动自愈:start.sh 启动前等 Qdrant readyz(30min)+Neo4j TCP(10min);
  backend_guard 标签校验改子集判定
- 样本配对:同 inode 去重优先真实文件,R1/R2 归一配对一对一认领
- gitignore 新增 *.bak-*/*.before-*/bioflow_service/bioflow.db

测试:bioflow_service pytest 358/358,前端 bioflow vitest 205/205

2026-09-24 16:48:52 +08:00

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app

feat(bioflow): 阶段进度条+滚动日志+点击定位全链;图片注入三修;QA启动就绪等待

2026-09-24 16:48:52 +08:00

tests

feat(bioflow): 阶段进度条+滚动日志+点击定位全链;图片注入三修;QA启动就绪等待

2026-09-24 16:48:52 +08:00

build.sh

fix(bioflow): 部署加固——生信服务 SSE 路由入编译白名单(断流崩溃根治同款)+bff_restart 杀进程按端口精确(防误杀 8098)

2026-09-06 06:54:45 +08:00

pytest.ini

feat(bioflow): P1 生信服务地基——bioflow_service 8098 独立部署树(12 服务模块+3 路由层+SQLite 三表+166 用例全绿)+BFF 流式反代/报告登记(BIOFLOW_ENABLED 开关默认关)

2026-09-06 05:36:10 +08:00

restart.sh

fix(deploy): restart 脚本 lsof 只取 LISTEN 态进程

2026-09-12 18:22:11 +08:00