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1.3 KiB
YAML
Executable File
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1.3 KiB
YAML
Executable File
# bbav20311 API 配置
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# 存放各数据库 API 的访问密钥和配置
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# NCBI API
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# 申请地址: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/account/
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ncbi:
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api_key: "" # 可选，提高速率限制到 10 requests/second
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rate_limit: 0.34 # 无 key 时 3 requests/second，有 key 时 0.1
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# Phytozome API
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# 申请地址: https://phytozome-next.jgi.doe.gov/
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phytozome:
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api_key: "" # JGI 账户 API key
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rate_limit: 1.0
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# TAIR API
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# 申请地址: https://www.arabidopsis.org/
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tair:
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api_key: "" # TAIR 订阅用户 API key
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rate_limit: 1.0
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# 通用配置
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settings:
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# 默认速率限制（秒）
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default_rate_limit: 1.0
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# 请求超时（秒）
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request_timeout: 30
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# 最大重试次数
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max_retries: 3
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# 缓存设置
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cache_enabled: true
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cache_ttl: 3600 # 缓存时间（秒）
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# 并行查询设置
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max_workers: 5
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query_timeout: 30
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# 数据库端点（一般不需要修改）
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endpoints:
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ncbi: "https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils"
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ensembl: "https://rest.ensembl.org"
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pfam: "https://www.ebi.ac.uk/interpro/api"
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plantcare: "http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plantcare/html/"
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phytozome: "https://phytozome-next.jgi.doe.gov/api"
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tair: "https://www.arabidopsis.org/api"
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planttfdb: "http://planttfdb.gao-lab.org/api"
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