potaserandClaude Opus 5
7097ecdec5
Co-Authored-By: Claude Opus 5 (1M context) <noreply@anthropic.com>
61 lines
1.9 KiB
Markdown
Executable File
61 lines
1.9 KiB
Markdown
Executable File
# 2026-03-30 修订进度记录
|
|
|
|
> 时间: 01:47
|
|
> 备份状态: ✅ 已完成 (bbav20311_backup_20260330, gene-family-mas-v2_backup_20260330)
|
|
|
|
---
|
|
|
|
## 修订计划
|
|
|
|
### Phase 1: 高优先级修订（并行执行中）
|
|
|
|
| 脚本 | 子Agent | 状态 | 开始时间 | 完成时间 |
|
|
|:---|:---|:---:|:---:|:---:|
|
|
| run_expression.py | agent:main:subagent:e775fc93-ecf4-4827-ac6f-4dc8ac452094 | 🔄 修订中 | 01:47 | - |
|
|
| run_interspecies_synteny.py | agent:main:subagent:b3090aee-a277-430b-8cdc-67d34a7a3550 | ✅ 已完成 | 01:47 | 01:50 |
|
|
| run_promoter.py | agent:main:subagent:48814e02-acbc-485d-82cf-5c42939369ab | ✅ 已完成 | 01:47 | 01:51 |
|
|
|
|
**已完成修订**:
|
|
- ✅ run_interspecies_synteny.py - manifest格式已符合schema v1标准
|
|
- ✅ run_promoter.py - 添加prepare_directories()，完善manifest（含figures字段）
|
|
|
|
### Phase 2: 中优先级修订（待执行）
|
|
|
|
| 脚本 | 评分 | 主要问题 |
|
|
|:---|:---:|:---|
|
|
| run_genome_prepare.py | 8.5/10 | manifest格式不完全规范 |
|
|
| run_synteny.py | 9/10 | prepare_directories()未独立 |
|
|
| run_karyotype.py | 9/10 | prepare_directories()未独立 |
|
|
|
|
### Phase 3: 低优先级修订（可选）
|
|
|
|
| 脚本 | 评分 | 主要问题 |
|
|
|:---|:---:|:---|
|
|
| run_motif.py | 9.5/10 | 几乎完整，仅需微调 |
|
|
| run_domain.py | 9.5/10 | 几乎完整，仅需微调 |
|
|
| run_identify.py | 9/10 | 良好，仅需微调 |
|
|
|
|
---
|
|
|
|
## 时间节点
|
|
|
|
- [x] 01:41 - 完成分析脚本规范性评估
|
|
- [x] 01:47 - 启动Phase 1修订（3个并行任务）
|
|
- [ ] 03:30 - 第一次备份
|
|
- [ ] 03:50 - 第二次备份
|
|
- [ ] 04:10 - 检查修订进度
|
|
|
|
---
|
|
|
|
## 修订位置确认
|
|
|
|
所有修订都在备份目录进行：
|
|
- 源目录: /home/xia-lab/wutx/00test/bbav20311/
|
|
- 备份目录: /home/xia-lab/wutx/00test/bbav20311_backup_20260330/
|
|
- 修订在备份目录进行，测试通过后复制回源目录
|
|
|
|
---
|
|
|
|
*记录位置: /home/xia-lab/wutx/00test/bbav20311/memory/2026-03-30-revision-progress.md*
|
|
*状态: ✅ 已记录*
|