docs(bioflow): A4 语料副本入库 + A1/A4 任务书勘误(docker build 自测权限、语料源路径)

Co-Authored-By: Claude Fable 5 <noreply@anthropic.com>
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2026-09-05 16:44:18 +08:00
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@@ -31,6 +31,7 @@ G. 阶段 → 镜像映射表(基因家族链约 18 阶段 → bioflow-gf 等
- 适配改动保持最小:除 A/B 清单外一律照抄 dev,发现第 3 处以上需适配的硬编码 → 记入报告交 TL 裁决
## 【自测要求】
- 镜像构建:开发/自测阶段的 docker build 由你执行(属自测动作,非发布);发布级镜像构建与 tagging 由 TL 执行。若 docker build 遇权限/磁盘问题 → 记入报告等 TL
- 金标 diff 命令输出为空(24 ID 全等);manifest 产出合规;镜像内 python -c "import gfa_core.xxx" 加载 .so 成功
- 冒烟脚本沉淀为 bioflow_kernel/tests/smoke_golden.sh
- 自测结果写入 docs/team/report_bioflow_dev1.md(完成清单、适配改动清单(逐条)、金标结果、冒烟结果、已知限制)
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@@ -7,7 +7,10 @@
## 职责范围(只动 vstore 侧新增集合与入库脚本;QA 树(8091)零改动;前端引用块渲染与 A3 协作)
A. 语料切块入库(vstore 新增独立集合 flow_docs,不混入既有公文/资料集合):
- 语料源(按优先级):1) Obsidian《PlantAI_现有分析全流程_基因家族_RNAseq_WGS_GWAS》(79 章,TL 提供导出副本)2) dev 的 gfa_core/schemas/stages/*_contract_v1.md(59 份阶段契约)3) 技能说明(dev docs 内分析方法说明)
- 语料源(按优先级):
1) Obsidian《PlantAI_现有分析全流程_基因家族_RNAseq_WGS_GWAS》——TL 已导出副本到仓库 docs/bioflow_corpus/PlantAI_现有分析全流程_基因家族_RNAseq_WGS_GWAS.md(79 章,只读使用;入库脚本以该副本为源,不依赖 Obsidian)
2) dev 的 gfa_core/schemas/stages/*_contract_v1.md(59 份阶段契约,复制源 /home/xzq/5090/teamWorkspace/zh/PlantAI-dev/,只读)
3) 技能说明(dev docs 内分析方法说明,只读)
- 切块策略:按章/节切块,块含标题路径 + 原文 + 源文件标记;入库脚本 vstore/scripts/ingest_flow_docs.py(幂等可重跑)
B. 生信对话内流程咨询:检索 flow_docs 集合 → 答案含引用原文(引用块带源文件与章节定位,UI 可跳转——跳转渲染与 A3 协作,接口约定写入报告)
C. 评估集:30-50 条(覆盖各链典型咨询:阶段输入输出/参数/前置条件/软件对照),评测脚本(检索命中 + 答案含引用断言)