 admin
|
0282cfeeeb
|
feat(bioflow): 阶段进度条+滚动日志+点击定位全链;图片注入三修;QA启动就绪等待
- 生信进度:后端新增 stage_progress 事件帧+进度解析白名单(rnaseq_qc/sample_qc),
kernel 日志流式落盘(20行/1s flush+fsync),logs 分页端点(offset/limit/eof),
事件 seq 跨重启扫描续增(2026-09-17 断流修复);前端 FlowProgressCard 确定性/
不确定两态进度条+点击定位到生信任务 TAB,BioJobsPane DAG 行展开滚动日志区
(3s 轮询),log_tail 4000 截断,重跑 stage_started 清零进度
- 图片注入:figures 三源重构(标准DOI图库主路径/遗留体系兜底/PMC兜底),
[[FIG:]] 宽松归一化识别 PMC/PMID/DOI 三种形态,引文兜底扩展至
[PMCID:]/[DOI:] 且标记未满配额继续注入,注入预算 90s/10篇(175 实测校准),
PMC graphic 无 content-type 宽松正则,空结果不缓存(176 冷连接三连败修复)
- QA 启动自愈:start.sh 启动前等 Qdrant readyz(30min)+Neo4j TCP(10min);
backend_guard 标签校验改子集判定
- 样本配对:同 inode 去重优先真实文件,R1/R2 归一配对一对一认领
- gitignore 新增 *.bak-*/*.before-*/bioflow_service/bioflow.db
测试:bioflow_service pytest 358/358,前端 bioflow vitest 205/205
|
2026-09-24 16:48:52 +08:00 |
|
 adminandClaude Fable 5
|
750e218541
|
fix(bioflow): 卡片防误操作+暂停立即生效+确认幂等
- 可调整参数卡「继续」成功后按钮隐藏,显示「参数已确认」
- 确认分析路径卡「确认创建任务」成功后按钮隐藏,显示「任务已创建」
- 后端 confirm_stage 幂等:已确认且 running/queued 的重复确认放行(不再 409)
- 暂停立即生效:docker run 加 --name,docker kill 终止执行容器,
running 阶段置 paused、任务即时暂停(kill 的 exit 137 不误判 failed)
- 340 后端用例 + 121 r3debug + 373 主套件全绿;已部署 176
Co-Authored-By: Claude Fable 5 <noreply@anthropic.com>
|
2026-09-16 18:01:24 +08:00 |
|