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# 基因提取质量验证指南
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> 生成时间: 2026-04-02
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## 📋 验证样本 (9个基因)
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| 序号 | 基因ID | 家族 | 物种 | 分组 | PDF来源 |
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|:---:|:---|:---|:---|:---|:---|
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| 1 | CYP85A1 | P450 | Solanum lycopersicum | Non_Aryan | 番茄p450 |
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| 2 | TCP34 | TCP | Panicum virgatum | Class_II | 柳枝稷TCP |
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| 3 | MADS38 | MADS | Citrullus lanatus | MIKC | 西瓜MADS |
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| 4 | ERF105 | AP2-EREBP | Oryza sativa | Group_C | 短柄AP2 |
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| 5 | ERF013 | AP2-EREBP | Oryza sativa | Group_A | 短柄AP2 |
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| 6 | SPL9 | SPL | Fagopyrum tataricum | Group_B | 苦荞SPL |
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| 7 | AG | MADS | Citrullus lanatus | Type_II | 西瓜MADS |
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| 8 | IQD5 | IQD Protein | Brassica rapa | Group_I | 白菜IQD |
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| 9 | IQD16 | IQD Protein | Brassica rapa | Group_II | 白菜IQD |
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## 🔍 验证步骤
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### 1. 找到对应PDF
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根据"PDF来源"列找到对应的PDF文件：
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- 番茄p450 → `paper/ceshi/番茄p450基因家族BMCgenomics2020.pdf`
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- 柳枝稷TCP → `paper/ceshi/柳枝稷TCP基因家族...`
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- 西瓜MADS → `paper/ceshi/西瓜MADSwang2019.pdf`
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- 短柄AP2 → `paper/ceshi/短柄AP2s12864-016-2968-8.pdf`
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- 苦荞SPL → `paper/ceshi/1pianV2/苦荞SPL2019...`
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- 白菜IQD → `paper/ceshi/白菜IQDyuan2019.pdf`
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### 2. 打开PDF搜索基因
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使用PDF阅读器的搜索功能，搜索基因ID (如: CYP85A1)
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### 3. 验证三个属性
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找到基因后，验证：
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- **家族**: 该基因是否属于标注的家族？
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- **物种**: 该基因是否来自标注的物种？
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- **分组**: 该基因是否属于标注的分组？
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### 4. 记录验证结果
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在下方表格记录：
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- ✓ = 正确
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- ✗ = 错误
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- ? = 不确定/未找到
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## 📝 验证记录表
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| 序号 | 基因ID | 家族[✓/✗/?] | 物种[✓/✗/?] | 分组[✓/✗/?] | 备注 |
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|:---:|:---|:---:|:---:|:---:|:---|
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| 1 | CYP85A1 | [ ] | [ ] | [ ] | |
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| 2 | TCP34 | [ ] | [ ] | [ ] | |
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| 3 | MADS38 | [ ] | [ ] | [ ] | |
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| 4 | ERF105 | [ ] | [ ] | [ ] | |
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| 5 | ERF013 | [ ] | [ ] | [ ] | |
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| 6 | SPL9 | [ ] | [ ] | [ ] | |
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| 7 | AG | [ ] | [ ] | [ ] | |
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| 8 | IQD5 | [ ] | [ ] | [ ] | |
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| 9 | IQD16 | [ ] | [ ] | [ ] | |
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## 📊 统计
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- 总验证数: 9个基因 × 3个属性 = 27项
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- 正确数: ___ 项
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- 错误数: ___ 项
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- 不确定: ___ 项
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- **准确率**: ___ %
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## 💡 验证技巧
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1. **基因家族验证**: 查看基因ID前缀
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- CYP* → P450家族
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- TCP* → TCP家族
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- SPL* → SPL家族
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- ERF* → AP2-EREBP家族
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2. **物种验证**: 查看论文标题或摘要中的物种名称
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3. **分组验证**: 查看系统发育树或表格中的分组信息
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- 通常Group A/B/C或Class I/II
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4. **快速验证**: 如果基因ID前缀与家族匹配，大概率正确
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## ⚠️ 注意事项
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- 有些基因可能在补充材料中，主文档可能找不到
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- 分组信息可能在系统发育树图中，需要查看图片
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- 如果找不到，标记为"?不确定"
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- 重点关注家族和物种，分组可作为参考
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*验证完成后，请更新准确率统计*
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