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# 修订记录 - 2026-04-13
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## 今日任务
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修复"/api/agent/execute"执行核型分析时返回错误阶段的问题
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## 问题描述
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用户说"帮我执行核型分析"，但系统执行了identify阶段，而不是synteny+karyotype阶段。
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## 根本原因
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1. `/api/agent/plan` 直接调用 `orchestrator.plan()` → PlanningAgentV2，正确返回['synteny', 'karyotype']
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2. `/api/agent/execute` 调用 `orchestrator.run()` → LangGraph → `_planning_node` → PlanningAgentV2
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3. `completed_stages` 在传递过程中丢失，PlanningAgentV2收到空列表
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## 已完成的修复
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### 1. IntentAgentV2 依赖定义统一
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**文件**: `gfa_core/mas/agents/intent_v2.py`
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- 将 `synteny` 依赖从 `["identify", "phylogeny"]` 改为 `["identify"]`
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- 添加 karyotype 关键词检查到 fallback 方法
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- 修改 LLM prompt，明确指示不要过度推断
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### 2. PlanningAgentV2 使用 completed_stages
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**文件**: `gfa_core/mas/agents/planning_v2.py`
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- 在 `_generate_plan_with_llm` 中添加逻辑，检查依赖阶段是否已完成
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- 添加调试日志 `print(f"[PlanningAgentV2] completed_stages: {completed_stages}")`
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### 3. 接受 partial_success 作为已完成状态
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**文件**: `apps/web/vue3/main.py`
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- `/api/agent/plan` 现在接受 `partial_success` 作为已完成状态
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### 4. LangGraphOrchestrator 使用 PlanningAgentV2
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**文件**: `gfa_core/mas/core/langgraph_orchestrator.py`
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- 将 `PlanningAgent` 改为 `PlanningAgentV2`
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- 修复 `state.get("user_input")` 可能为 None 的错误
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- 在 `_to_agent_state` 中添加 `completed_stages` 传递
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### 5. tasks.py 使用 LangGraphOrchestrator
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**文件**: `tasks.py`
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- 将 `Orchestrator` 改为 `LangGraphOrchestrator`
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- 添加 `messages` 字段到 initial_state
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- 添加 `completed_stages` 查询逻辑
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- 添加调试日志
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### 6. GraphState 添加 completed_stages 字段
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**文件**: `gfa_core/mas/core/state.py`
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- 添加 `completed_stages: list[str]` 字段
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## 当前状态
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### 验证结果
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**`/api/agent/plan` 测试**:
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```bash
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curl -s "http://localhost:7867/api/agent/plan" \
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-X POST -H "Content-Type: application/json" \
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-d '{"message":"帮我执行核型分析","session_id":"job_1776004000991"}'
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# 返回: ['synteny', 'karyotype'] ✅ 正确
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```
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**`/api/agent/execute` 调试日志**:
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```
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[tasks.py] Completed stages: ['identify', 'phylogeny'] ✅ 正确查询
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[PlanningAgentV2] completed_stages: [] ❌ 收到空列表
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```
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### 待解决问题
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`completed_stages` 在从 `tasks.py` 传递到 `PlanningAgentV2` 的过程中丢失
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可能原因:
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1. LangGraph 工作流中 state 被修改导致 `completed_stages` 丢失
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2. `_to_agent_state` 方法没有正确读取 `completed_stages`
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3. RouterAgent 或其他节点修改了 state
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## 明日计划
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1. 修复 `completed_stages` 传递丢失问题
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2. 验证 `/api/agent/execute` 正确返回 ['synteny', 'karyotype']
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3. 测试完整执行流程
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## 总体计划
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1. 修复阶段依赖识别问题 ✅
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2. 修复 completed_stages 传递问题 ⏳
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3. 测试核型分析完整流程 ⏳
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4. 修复其他潜在问题 ⏳
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## 今日完成任务数
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**已完成**: 6 项修复
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**进行中**: 1 项（completed_stages 传递）
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**剩余**: 3 项
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